位点上的一基因与其等位基因不发生互作时的效应。亲代传递给子代的是基因而不是基因型，所以在探讨一个群体遗传结构的性质时，有必要采用一种能度量个别基因效应的数值。依求出这种效应所采用的方法不同，称为基因平均效应或基因代换效应。

研究及估算方法 研究基因的效应，是在一个遗传平衡的群体(见遗传平衡)中，从一对等位基因A-a的位点着手的。设其基因A的频率为p，a的频率为q。其基因型频率为p2AA：2pqAa：q2aa。再分别用d、h和-d表示这三种基因型的基因型值。由于基因的加性效应，是以距群体平均数的离差来表示的，所以在估算其效应值时，先要求出群体的平均数，其估算方法概列 ......