1901年在台湾省被日本占领期间创立， 原名“甘蔗试验场”， 1906年更名“糖业试验场”。1932年改为“台湾糖业试验所”， 隶属台湾总督府。1945年台湾光复后， 更名为“台湾省糖业试验所”。1974年起改用现名，隶属于“台湾糖业公司”。地址在台湾省台南市生产路。

初仅从事甘蔗品种改良工作， 其后增加研究制糖化学及糖蜜、蔗渣副产品利用。设有育种、栽培、植物营养、植物保护、制糖化学、副产品利用等六个研究系; 资料、推广、农场管理等三个中心; 万丹育种场、昌隆育种站、露菌病抗性测定圃;并附设虎尾、新营、屏东三个“蔗作实验场”。现有员工约400名，其中科技人员约150名(博士、硕 ......