对每头牛按预定的编码序进行号码标记。编号应遵循简便、容易识别、方便管理的原则。编号方案一旦确定则不能轻易更改。如以出生年度和序号为原则进行编号， 则要包括两部分。如1992年1月1 日出生的第一头犊牛，可编为“92001”号。序号可根据畜群大小，选定适当的位数。公母犊可用相同号码。为了育种工作方便，还有把父亲或母亲的号冠于编号之前或附在编号之后的。较复杂的编号中尚包含场号和品种号。不过编号上代表的意思越多，号码字数就越多，标记操作越麻烦，有时还可能标记不清楚而失去意义。

标记的方法分永久性和临时性两种。永久性标记包括刺字(耳、乳镜)、剪耳号、描花片 ......