该所建于1957年。初为安徽省棉花试验站(站址于濉溪县)，隶属安徽省农业厅领导，后改为淮北棉花研究所;1962年收归安徽省农科院领导;1964年迁址安庆市郊，改为安徽省农业科学院安庆棉花研究所;1969年下放为安庆市代管;1978年4月收归安徽省农林科学院领导，更名为安徽省农林科学院安庆棉花研究所;1978年底，更名为安徽省农业科学院安庆棉花研究所;1995年更为现名。下设栽培、育种、植保和化验等4个研究室，还设有办公室和开发部。拥有科研用地8.7公顷和常规生物生化测试分析仪器。

该所有职工54人，其中技术干部31人，高级研究人员5人，中级研究人员18人。主要任务是，进行棉花优质高产多抗新品 ......