实验用大鼠、小鼠、豚鼠、仓鼠和沙鼠等动物的寄生虫主要有：鞭毛虫、孢子虫、球虫、脑胞内原虫、蛲虫、绦虫和螨、虱类。

原虫类 鼠六鞭毛虫或鼠称螺核原虫，广泛存在于小鼠、裸鼠、大鼠、仓鼠和各种野生啮齿类中。通常仅在刚离乳小鼠中可显现临床征候。以滋养体寄生于鼠的前段小肠腺窝。虫体呈梨形，有两个前核，两个生毛体，共8条鞭毛，其卵形包囊散布在大、小肠腔内，随粪排出体外，对环境有抵抗力，经粪、口途径传播。发病鼠精神呆滞，消瘦、腹胀、腹泻，幼鼠可大量死亡(20～50%)。以0.04～0.1%二甲硝基咪唑饮水，可防治。鼠贾第鞭毛虫，寄生于小鼠、大鼠、仓鼠及各种野生啮齿 ......